27 oktyabr 1992-ci ildə yaradılmış Azərbaycan Milli Elmlər Akademiyası Azad Həmkarlar İttifaqı 50 ilk təşkilatı və 10144 üzvü özündə birləşdirir. 1998-ci ildən Azərbaycan Milli Elmlər Akademiyası Azad Həmkarlar İttifaqı Azərbaycan Həmkarlar İttifaqları Konfederasiyasının tərkibinə daxil olmuşdur.
Azərbaycan Milli Elmlər Akademiyası Azad Həmkarlar İttifaqının qurultayı 5 ildə bir dəfə keçirilir. Qurultayın keçirilmə vaxtı Məclis tərəfindən müəyyən edilir. Sonuncu Qurultay 17 noyabr 2017-ci ildə keçirilmişdir.
Qurultaylar arası dövrdə ali orqan Məclisdir. Məclis ildə 2 dəfə keçirilir. İttifaqın Rəyasət Heyətinin iclası ayda 1 dəfə keçirilir.
2020-2022-ci illər Azərbaycan Milli Elmlər Akademiyası Azad Həmkarlar İttifaqının və Milli Elmlər Akademiyasının Rəyasət Heyəti arasında kollektiv saziş, ilk həmkarlar ittifaqı təşkilatları ilə işəgötürənlərlə kollektiv müqavilələr bağlanmışdır.
